Single-cell
Sequenzierung
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Bei der Single-cell Sequenzierung werden die Sequenzinformationen von einzelnen Zellen untersucht, was eine höhere Auflösung der zellulären Unterschiede und die Bestimmung der Merkmale einzelner Zellen ermöglicht.
Was wir anbieten
Instrumente
wir bieten Sequenzierungsläufe auf NovaSeq 6000-Instrumenten an
maximale Freiheit
beim Befüllen kompletter Flow Cells sind Sie völlig frei in der Wahl der Lauf-Settings
Hochwertige Sequenzierung
Mit außerordentlicher Erfahrung in der Sequenzierung erbringen wir unsere Dienstleistungen in einem akkreditierten Rahmen
Verschiedene Arten der bioinformatischen Unterstützung
je nach Versuchsaufbau können verschiedene Analysepipelines von Interesse sein
Unser Prozess
Wir bei MLLSEQ haben die Sequenzierkapazität und die Erfahrung, um Sie mit unserem Fachwissen zu unterstützen. Wir bieten die Sequenzierung und Datenvorverarbeitung Ihrer Ready-to-load-Libraries an.
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Sequenzierung
Bei MLLSEQ wird die Sequenzierung mit der Illumina Sequencing by Synthesis Methode auf der neuesten Generation von Sequenziergeräten, dem NovaSeq 6000, durchgeführt. Je nach Eigenschaften der Library sind verschiedene Sequenzierungs-Settings verfügbar.
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Datenvorverarbeitung
Für 10x Genomics Single Cell Genexpressions- und ATAC-Libraries werden die erhaltenen Sequenzierungsdaten mit der Cell Ranger/Cell Ranger ATAC-Pipeline vorverarbeitet:
- mkfastq: Demultiplexing der Sequenzierrohdaten, um probenspezifische FASTQ-Dateien zu erhalten
- count: Alignment, Filterung, Barcode-Zählung, UMI-Zählung, usw.